Нивото на маркера СА-125 наистина се повишава при някои злокачествени заболявания (на яйчниците, на матката, на стомаха и др.), но също така се повишава при натрупване на течност в корема без наличие на тумор, при доброкачественото гинекологично заболяване ендометриоза и др. Маркерът СА-125 можи да е повишен и при напълно здрави хора, които пушат над 20 цигари дневно. Повишеното ниво на СА-125, взето само по себе си, не може да постави диагноза.
Най-сигурното разпознаване на вида яйчникова киста е свързано с изследване на тъканта на кистата под микроскоп, т.е. след като тя е отстранена от организма. Тъй като не всички яйчникови кисти налагат оперативна намеса, ние се задоволяваме с приложение на други методи. Съчетанието между серия от клинични прегледи при добър гинеколог, вагинална ехография и лабораторни изследвания (включително за туморни маркери) се приема като достатъчно достоверен диагностичен набор.